Descrição
A proteína 1 de translocação do linfoma do tecido linfoide associado a mucosa (MALT1) é uma proteína chave na resposta do sistema imune adaptativo em humanos. Nesse sentido, a MALT1 é de suma importância na regulação de eventos inflamatórios nos mais variados tecidos, em que sua desregulação está associada ao surgimento e sobrevivência de vários tipos de câncer. Dito isso, a MALT1 se torna um alvo promissor para o desenvolvimento de fármacos para o tratamento de diversas doenças, entretanto, a falta de literatura descrevendo seu comportamento conformacional complexo dificulta consideravelmente a proposição de novos fármacos. Assim sendo, visou-se investigar o comportamento conformacional da MALT1 durante a inibição alostérica por meio do inibidor MLT-748, em que para isso simulações de dinâmica molecular (DM) enviesadas, redes neurais, e ancoragem molecular foram utilizadas.
A partir da investigação feita foi observado que os Loops 1 e 3 do domínio paracaspase da proteína MALT1 apresentaram movimentos crucias, em que estes eram capazes de reduzir o volume do sítio catalítico da proteína. A partir de cálculos de ancoragem molecular covalente utilizando a substância Z-VRPR-fmk, um mímico do substrato, foi observado que a redução do volume catalítico foi capaz de inibir a atividade catalítica da proteína. Além disso, através da exploração do espaço conformacional da proteína por meio das simulações de DM enviesadas e redes neurais, informações estatísticas foram obtidas, em que se observou que após posicionamento do inibidor alostérico MLT-748 cerca de 96,2% das conformações exploradas eram inativas. Nesse sentido, o presente trabalho contribui de forma significativa para a compreensão da inibição alostérica da proteína MALT1, em que os dados apresentados se apresentam como importantes métricas para a proposição computacional de novos inibidores alostéricos para a proteína MALT1.
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